1966年に4歳（現3歳）以上の牝馬限定の別定の重賞競走、京都牝馬特別として創設、第1回は京都競馬場の芝2000mで施行された。

1968年から現在の芝外回り1600mに、また1983年には開催時期が変更され、出走資格も5歳（現4歳）以上となり現在と同じ条件となった。

1984年には積雪の影響でダート1400mで施行された。

2001年から現在の京都牝馬ステークスに名称変更され、

2005年には国際競走に指定された。

本競走の優勝馬には、ダイイチルビー、ノースフライトなど牡馬と争い短距離GI競走を制した馬がおり、

ヴィクトリアマイルに続く牝馬短距離路線の開幕戦としてさらに重要性が増している。




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